Präzise Brüche von DNA durch Ultraschall
Dass DNA unter Ultraschall mit hoher Energiedichte beschädigt werden kann und sogar in kleinere DNA-Fragmente zerbricht, ist bereits seit Längerem bekannt. In Zusammenarbeit mit der experimentellen Gruppe von Professor Andreas Herrmann aus Aachen ist es uns gelungen, die vormals ungerichtete Fragmentierung der DNA auf gezielte Schwachstellen zu fokussieren, die durch enzymatisch vorbestimmte Teilbrüche im Phosphatrückgrat der DNA, sogenannte nicks, definiert sind.
Der Mechanismus dieser neuartigen DNA-Fragmentierung durch Ultraschall konnte durch die Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten und Molekulardynamik-Simulationen in unserer Gruppe aufgeklärt werden. Die Ergebnisse wurden kürzlich in der Fachzeitschrift Chem veröffentlicht (DOI).
